Para lançar um valor de Adiantamento ao fornecedor é necessário cadastrar um histórico de conta corrente, como débito e marcado como Adiantamento.
Módulos->Cadastros->Financeiro->Histórico de Conta Corrente
Lançar um título um título no contas a pagar com o valor do adiantamento, e fazer a baixa usando o histórico.
Irá lançar um débito para o Fornecedor->Financeiro->Adiantamento
Irá lançar um débito do valor pago no contas correntes.
Ao fazer a baixa no contas a pagar em um próximo título para esse fornecedor vai dar mensagem que o fornecedor possui débito de adiantamento, perguntado se deseja abater na baixa.
Clicando em sim vai abrir a tela trazendo os débitos de adiantamento em aberto para esse fornecedor, podendo escolher qual Adiantamento quer abater. Caso deseje abater somente um valor parcial, ao clicar no botão valor parcial ira abrir a tela para informar o valor a ser abatido naquela baixa.
Na baixa vai gerar uma linha com o valor na coluna desconto. E vai abater do débito do adiantamento do Fornecedor. 
Existe o recurso também no contas a receber para o caso da empresa receber um adiantamento de cliente, só precisa cadastrar um histórico de adiantamento de crédito.
Módulos->Cadastros->Financeiro->Histórico de Conta Corrente
